### 具体设计规则
长度:合成PNA序列的长度一般不应超过18个碱基,但接头、氨基酸和标记物不算在内。
氨基酸:可将赖氨酸或半胱氨酸连接到序列的N端或C端。
嘌呤含量:浓度过高的嘌呤会导致PNA易于聚合并且水溶性差。为避免聚合反应,应遵循以下原则:将嘌呤含量控制在60%以下。例如,序列GATTAGCAGTCTACG符合要求(嘌呤含量<60%),连续的嘌呤不超过4个,而鸟嘌呤的最大连续数应限定为3个。例子包括:ATTAGGGGCATCTAC(不符合要求,因连续有4个G)、CTAGATAGAAGGTTC(不符合,因连续有6个嘌呤)。如果无法避免上述规则,可以考虑设计互补探针。例如,GTAGATGCCCCTAAT(符合,互补序列未违反任何准则)以及GAACCTTCTATCTAG(符合,互补序列)。
### 避免自我互补序列
避免出现反向重复、发夹和回文序列。由于PNA/PNA的互作强度大于PNA/DNA,这类探针更易出现聚合现象。四个碱基的互补是允许的,但仅限含C和G的互补。若有其他碱基间隔,四个碱基的互补仍是可行的。例如,GATAATTGCA(符合,四个碱基互补),而GATCCGGTAC(不符合,仅有CCGG互补)。TATCCTGGTA(符合,CC与GG间隔一个碱基)。对于六个或更多碱基的互补则不被允许。例如,CTATTAATGCA(不符合,六个碱基互补)。不过,如果用其他碱基间隔,则六个碱基互补是允许的,前提是不能全为C和G。例如,AGTGCTACT(符合,有间隔),但GCGGCTCGC(不符合,仅有G和C互补)。即便有其他碱基间隔,八个碱基的互补也不可行,例如ACTGTCAGT(不符合,因有八个碱基互补)。
### 一般规则
我们强烈建议设计反向平行的PNA探针。PNA可以在任一方向形成双链,但反向平行排列更为优先,因其形成传统的双链结构。这在反义和DNA探针的应用中显得尤为重要。反向平行排列时,PNA探针的N端对应于DNA的5'端。需要注意的是,PNA的熔点与DNA有所不同。由于PNA链不带电,PNA-DNA的Tm值通常高于相应的DNA-DNA。当在100mMNaCl环境中,每增加一个碱基,Tm值大约提高1°C。在较低盐浓度下,这种Tm值差异更加明显。通常情况下,含10个碱基的PNA序列的Tm约为50°C,而含15个碱基的PNATm值约为70°C。最佳长度为12至17个碱基,具体应根据应用决定。与DNA应用相比,PNA探针所需的序列较短。较长的PNA链倾向于聚合,难以纯化和表征,但短序列的特异性更强,因此不匹配的影响更显著。
### 订购PNAPNA 价格与交货
PNAPNA的价格取决于序列长度、产量、纯度及修饰标记。如需订购,请将具体需求发送给我们,尊龙凯时会尽快联系您。最低订购量为未标记的PNA为20nmole,标记的PNA为10nmole。提供90%和95%两种纯度供选择,并附有HPLC纯度分析和质谱分析报告。一般交货周期为2-3周,若为gammaPNA或修饰标记则需3-4周。
### 精选引用
想了解使用尊龙凯时的PNA展开的最新研究文献吗?以下是一些精选的文献:
- Exponential Increase in an Ionic Signal: A Dominant Role of the Space Charge Effect on the Outer Surface of Nanochannels (Anal Chem | 28 Sep 2021) 所有单链PNA序列均由SBS Genetech Co., Ltd.(北京,中国)采购。
- Peptide Nucleic Acid-Functionalized Nanochannel Biosensor for the Highly Sensitive Detection of Tumor Exosomal MicroRNA (Anal Chem | 30 July 2021) PNA由SBS Genetech Co., Ltd.(北京,中国)合成。
- Table S1显示了上述提到的寡核苷酸序列 (Ultrasensitive Exosomal MicroRNA Detection with a Supercharged DNA Framework Nanolabel, Anal Chem | 2 April 2021) 具有−(CH2)6−间隔的巯基PNA在5′端由SBS Genetech Co., Ltd.(北京,中国)合成并纯化。所有序列在Table S1中列出。
通过以上信息,我们希望您能对PNA的设计和应用有更全面的了解,同时我们期待在未来的研究中,尊龙凯时能为您的科学探索提供支持。